Koira - oli se sitten rotukoira tai monirotuinen - kannattaa aina rekisteröidä Suomen Kennelliittoon. Rekisteröinti yhdessä tunnistusmerkinnän kanssa on kuin koiran henkilötunnus – niistä pystyy selvittämään koiran alkuperän ja yhdistämään koira omistajan tietoihin.
Kun koira rekisteröidään ja tunnistusmerkitään, koira on yksilöitävissä ja sen tiedot pystytään yhdistämään omistajan tietoihin. Jos koira katoaa, tunnistusmerkitty ja rekisteröity koira voi palautua kotiin parhaimmillaan heti löydettäessä. Rekisteröinti helpottaa myös eläintautien torjuntaa, eläinten hyvinvoinnin valvontaa ja ongelmatapauksiin puuttumista.
Rekisteröinti on myös keino suitsia pentutehtailua, sillä sen avulla voidaan seurata nartulla teetettyjen pentueiden määrää. Lisäksi se mahdollistaa Kennelliiton yleisen jalostusstrategian mukaisen vastuullisen jalostuksen valvomisen, sillä jalostuksessa käytettävien rekisteröityjen koirien terveys koe- ja näyttelytulokset voidaan varmistaa jalostustietojärjestelmästä.
Monirotuinen koira voidaan ilmoittaa Kennelliiton tunnistusmerkintätietokantaan, jolloin se voi osallistua monien harrastuslajien, kuten agilityn ja tottelevaisuuskoulutuksen, kisoihin.
Koiran alkuperästä riippuen sen rekisteröinnistä vastaa kasvattaja tai koiran omistaja.
Pentueet rekisteröi aina kasvattaja, joka huolehtii myös tunnistusmerkinnästä. Rekisteröinnin jälkeen pentujen sukutaulut sekä terveys-, koe- ja näyttelytuloksia voi lukea kaikille avoimesta tietokannasta, jalostustietojärjestelmästä. Kasvattaja antaa rekisteritodistuksen pennun ostajalle. Rekisteritodistus sisältää rotukoiran tiedot sekä sukutaulun ja toimii vakuutena siitä, että pentue täyttää Suomen Kennelliiton rekisteröintimääräykset.
Ostajan tulee huolehtia siitä, että hän tekee Kennelliitolle ilmoituksen koiran omistajamuutoksesta joko Omakoira-palvelussa, Omakoira-mobiilisovelluksella tai postitse. Omien yhteystietojen pitäminen ajan tasalla on erittäin tärkeää, jotta löydettäessä koiran omistaja voidaan tavoittaa.
Ulkomailta tuodun koiran rekisteröinnistä vastaa koiran omistaja samoin kuin monirotuisen koiran ilmoittamisesta tunnistusmerkintätietokantaan.
Kotimaisten rotukoirien kantakirjarekisterinumeroista kertovat FI-, EJ- ja ER-alkuiset rekisterinumerot. FIX-tietokantaan merkityllä monirotuisella koiralla on FIX-tunniste.
